Ο Ιωάννης, πριν από τρία χρόνια, είχε καταδικαστεί σε ποινή φυλάκισης 5,5 χρόνων για υπεξαίρεση 250.000 ευρώ την περίοδο 1998 - 2002, όταν ήταν μητροπολίτης Βελεσσών και Παραβαρδαρίου της αποκαλούμενης «Μακεδονικής Ορθόδοξης Εκκλησίας»
Η αποφυλάκιση του Ιωάννη αναμενόταν χθες το απόγευμα, όμως λίγες ώρες πριν, η Γενική Εισαγγελία άσκησε έφεση, κρίνοντας πως αν απελευθερωθεί, μπορεί να επαναλάβει τις ποινικές πράξεις για τις οποίες έχει καταδικαστεί.
Το ενδεχόμενο αποφυλάκισης του Ιωάννη είχε δρομολογηθεί τις προηγούμενες ημέρες, ύστερα από σχετικό αίτημα του Συμβουλίου Φυλακών των Σκοπίων, το οποίο έγινε αποδεκτό από τις δικαστικές αρχές, λόγω υποδειγματικής συμπεριφοράς του και καθώς είχε εκτίσει πάνω από το ήμισυ της ποινής του (τρία χρόνια από τα 5,5 χρόνια στα οποία είχε καταδικαστεί). Τελικά, η αποφυλάκισή του αναστέλλεται, τουλάχιστον μέχρι την εξέταση της έφεσης που άσκησε η Γενική Εισαγγελία.
Ο Ιωάννης, πριν από τρία χρόνια, είχε καταδικαστεί σε ποινή φυλάκισης 5,5 χρόνων για υπεξαίρεση 250.000 ευρώ την περίοδο 1998 - 2002, όταν ήταν μητροπολίτης Βελεσσών και Παραβαρδαρίου της αποκαλούμενης «Μακεδονικής Ορθόδοξης Εκκλησίας». Ο ίδιος θεωρεί τις κατηγορίες και διώξεις εις βάρος του υποκινούμενες από τις αρχές της ΠΓΔΜ.
Ο Ιωάννης αποπέμφθηκε το 2002 από τις τάξεις της αποκαλούμενης «Μακεδονικής Ορθόδοξης Εκκλησίας» διότι είχε υποστηρίξει συμβιβαστική πρόταση για την εξεύρεση λύσης στη διαφορά μεταξύ της Σερβικής Ορθόδοξης Εκκλησίας και της αποσχισθείσας «Μακεδονικής Ορθόδοξης Εκκλησίας», πρόταση που είχε απορριφθεί από την εκκλησία της ΠΓΔΜ, η οποία και απέπεμψε τον Ιωάννη από τους κόλπους της.
Η ορθόδοξη εκκλησία της ΠΓΔΜ αποσχίσθηκε το 1967 από την Σερβική Ορθόδοξη Εκκλησία και κήρυξε το αυτοκέφαλό της με την ονομασία «Μακεδονική Ορθόδοξη Εκκλησία», η οποία δεν αναγνωρίζεται από καμία Ορθόδοξη Εκκλησία του κόσμου.
Οι σχέσεις των εκκλησιών της Σερβίας και της ΠΓΔΜ έχουν διαταραχθεί ιδιαίτερα τα τελευταία χρόνια, κυρίως λόγω της δίωξης του αρχιεπισκόπου Ιωάννη, ο οποίος από το 2002 που αποπέμφθηκε από τις τάξεις της αποκαλούμενης «Μακεδονικής Ορθόδοξης Εκκλησίας» βρίσκεται συνεχώς στο στόχαστρο των διωκτικών αρχών της ΠΓΔΜ.
Αμέσως μετά την αποπομπή του, ο Ιωάννης προσχώρησε σε κοινωνία με τη Σερβική Ορθόδοξη Εκκλησία και προχώρησε στην επανίδρυση της «Ορθόδοξης Αρχιεπισκοπής της Αχρίδας» στην ΠΓΔΜ (έτσι λεγόταν επισήμως μέχρι το 1967 η μετέπειτα αυτοαποκαλούμενη «Μακεδονική Ορθόδοξη Εκκλησία») και ορίστηκε αρχιεπίσκοπός της.
Οι διώξεις εις βάρος του Ιωάννη από τις δικαστικές αρχές της ΠΓΔΜ έχουν επικριθεί έντονα από διεθνείς οργανισμούς και από το Στέιτ Ντιπάρτμεντ, ενώ την αποφυλάκισή του έχουν ζητήσει επανειλημμένα τόσο η Σερβική Ορθόδοξη Εκκλησία όσο και ο Οικουμενικός Πατριάρχης Βαρθολομαίος.
Η «Ορθόδοξη Αρχιεπισκοπή της Αχρίδας», επικεφαλής της οποίας είναι ο Ιωάννης και η απήχησή της είναι περιορισμένη στην ΠΓΔΜ, δεν αναγνωρίζεται από τις αρχές και η δράση της είχε θεωρηθεί ότι είναι «απειλητική» για τη χώρα.
